深圳科信局局长刘忠朴表示，本年度的科技创新奖取消了奖励等级，同时奖金总额也提高至2000万元；在申报方面，以前由部门推荐，现在以直接申请为主；过去奖励以项目为主，今年奖励以团体、个人为主。他介绍说，今年的申报数量为2005年的三倍，企业获奖率达到70%，在703位获奖人员当中，青年研发人员占80%以上。

　　据介绍，2006年度的市长奖除企业家类外，还增设了技术领军人物类奖项，不过本届该奖项空缺。此外，“华为移动软件交换解决方案”等45项成果获产业化(企业)类创新奖；“中国人群血型基因结构的研究及其应用”等10项成果获医疗卫生类创新奖；“纳米碳管分子器件的量子输送”等6项成果获高管院校类创新奖，“深圳地铁一期工程机电设备信息化集成应用”等2项成果获重大工程(项目)类创新奖；“建立功能基因组与生物芯片创新技术平台开发新药产品”等7项成果获科研机构类创新奖；“SMA在高温多雨地区的工程应用研究”等5项成果获引进消化吸引再创新类创新奖；深圳迅雷网络技术有限公司等6家公司获最具成长性企业类奖。