IMF小组这次的任务是找回一批被盗的病毒，因为这种病毒拥有毁灭人类的能力。但是在行动中，小组的成员接连被杀害，而这一切都是由恐怖分子头目肖恩-安布罗斯一手策划的。伊森-韩特(汤姆-克鲁斯饰)与前一集的好搭档--黑人电脑天才路瑟，从澳洲到西班牙，一路追踪安布罗斯这个可怕的敌人，并在最后关头阻止了安布罗斯的毁灭计划，完成了这项不可能完成的任务。
　　本片改编自60年代著名电视剧集，由汤姆-克鲁斯亲自担任制片。片中的一些惊险镜头都由克鲁斯亲自承担。在拍摄伊森徒手攀岩的一场戏时，克鲁斯不顾制片方的劝阻，独自在1500英尺高的峭壁上向极限挑战。在实拍过程中，他不慎脚下打滑，幸亏抓住了身边的保险绳才转危为安，连观阵的吴宇森也吓出了一身冷汗。
　　片中还有不少吴宇森式的动作片经典镜头，诸如放飞白鸽、飞身开枪、慢镜场面等等。影片的拍摄可谓历尽曲折，主要原因是克鲁斯的日程安排得过于紧密。在这两年的时间里，克鲁斯除与妻子妮柯尔-基德曼主演了斯坦利-库布里克的遗作《大开眼戒》，这在一系列电视节目中出现，并在数部电影中担任客串角色。在《碟中谍2》即将封镜的时候，克鲁斯又接手为迪斯尼的卡通片配音。斯皮尔伯格也邀请他在自己的新片《MinorityReport》中担任角色。对此，导演吴宇森只得对原定的拍摄计划作出根本调整调整，以尽量错开克鲁斯的档期。